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虽然顶着东北军的名号，但是这支“东北军”并不是在东三省活动。居正在青岛设立了中华革命军东北军总司令部后，迅速招兵买马，来者不拒。结果胶东各县的民团和一些来自辽东绿林武装纷纷投靠其麾下，另外还有部分警察、退伍士兵、反正的北洋军和自愿参加反袁运动的热血青年。在这些人中，青年学生是抱着满腔的爱国热忱参加护国讨袁运动的，他们的政治热情和思想觉悟都比较高，虽然军事技术较差，但纪律严明，自觉性高，至于其他成分就很难说了。
那些东北的“红胡子”，虽然归顺了革命，可恶习不改，“五大团”则自由行动，到处抢劫，军纪荡然，百姓怨声载道。至于警察、退伍士兵和反正的旧军自不待说，旧中国向来兵、匪一家。
即便是民团，也不单纯，里面即混有不少日本特务。因为自第一次世界大战爆发后，日本即把东北视为其势力范围，在山东派遣了不少特务间谍，其中有些就钻进了中华革命军，以中华革命军东北军作掩护，从事间谍活动，“经常将东北军的编制、军事部署和行动计划等向日本的间谍大田报告，等等。”反正的旧军，也潜逃成风。
作为军事科班出身的蒋志清立刻发现了革命军的问题所在，首先是总司令部机构不健全。总司令部没有侦察员，参谋处没有侦察科，而侦察科则是部队的眼睛，不侦察敌情就不能知彼知己；整个东北军也没有军医。
其次是规章制度不健全。总司令部各处没有编制表，也没有各师、团的花名册，整个部队有多少确切人数都不知道。总司令部也没有总值日员，各处、师、团也没有值日员，人员进出随随便便。军械科、经理局没有自己的会计制度，各师、团的现有武器也没有报表等等。
再有部队军纪很差。第一师某部发生“在南流附近各村庄抢劫焚掠等事”。随后他又发现官兵们经常身着军装进入民居店铺座谈，一些军官经常体罚士兵，任意罚跪，各处站岗的哨兵口号不明，士兵扛枪时扛枪的姿势也不统一。
为了加强中华革命党对“东北军”的控制和领导，已经升为参谋长的蒋志清开始着手整顿东北军。
他首先建议总司令部“添侦探员数名”，参谋处设“谍报一科”。整个东北军也没有军医，他又建议总司令部设军医科，各师、团队亦应设军医，战时救死扶伤，平时整顿卫生；
他又建议建立和健全各种规章制度，建议总司令部应设总值日员一名，“由参谋与副官各处长轮流担任”，各师、处也要设值日员，以与总司令部联系汇报。各处应建立编制表，各师、团应向总司令部递交所属部队的花名册。军械科、经理局应建立健全的会计制度，军械科的各种军械武器、经理局的收支款项，都应造具表册，以备查核。各师、团现有武器军械，亦应造表上报，各部队的起居和训练时间要统一。总司令部的出入人员应有出入证，“总司令部各物持出时，拟发持出证为凭”等等。
他还发出了一系列条令，加以改正。他要求第一师旅长赵中玉对所部在南流附近的抢掠事件进行认真查处，规定嗣后兵卒不得身着军服在各铺户座谈，及行路时不得向商民恫吓、敲诈等。各站岗的哨兵口号要一律明确，官兵扛枪的方式要一律枪身向右，以归统一。兵士有过，不准罚跪，以保军人体面，等等。此外，鉴于部队士兵高矮悬殊，老少不齐，他还建议裁汰老弱，以后征兵时，对于应征者的年龄、体格和文化程度都要有一定的要求。
蒋志清的这一系列整顿措施，对于建设一支有坚强战斗力的革命队伍是十分必要的。但是，他的这些整顿措施，只是停留在向部队发布一些条令的水平上，并没有认真加以落实，实际都成为一纸空文，而且，他对部属的态度也很粗暴，喜欢和人争吵，到部队不几天，即与好几个同事闹过了。各中下级军官纷纷反映，说他刚愎自用，太不和气，作威作福，目中无人。
后来又发生擅自撤查团长王贯仁一事，更使得蒋失去人心。王贯仁为朱案青师的一名团长，行伍出身，原系旧军，护国讨袁运动兴起后，加入中华革命军东北军。可他虽然加入了中华革命军的东北军，但军阀作风未改，平素对部队的训练很不认真，纪律松弛，蒋志清对此已十分恼火。后来王贯仁用手段抢了贾姓少女为妾。
事情发生后，蒋志清擅用许崇智的名义革除王贯仁职务。王贯仁事件在东北军中产生了强烈的反响，引起许多旧军人和“红胡子”们的强烈不满和反对。此后不久，蒋志清就离开了东北军。总计他在东北军中担任参谋长的时间前前后后一共十三天。
蒋志清的仕途不顺利，李默涵这里也发生了一些插曲，是关于兵工厂仿制火炮。
话说李默涵的兵工厂试制成功了105毫米和115毫米口径的两种火炮，后来又得到一门日军的120毫米口径火炮样品。于是全厂人就开始全力以赴地仿制120毫米口径的大炮。不过，由于技术力量的限制，试验可谓一波三折，报废了好多120毫米的特种钢管。
中国人素来有勤俭节约的传统，工厂里有个叫胡胤德的工人看到好多报废的特种钢管觉得很可惜，于是就截下还能用的部分，利用业余时间和一些边角料做出了一门120毫米口径的迫击炮。
这事正好让正在受处罚的裴余庆发现了，“胡胤德，你知不知道做私活儿是要被开除的？”
胡胤德赶紧告饶，“裴管事，我这用的都是废料，也不是为自己做的。我只是看这些材料报废了可惜~~”
“哈哈哈~”裴余庆拍了拍胡胤德的肩膀，笑道：“吓唬你的。你也知道我们大帅，金子银子对成山，但一向不喜欢铺张浪费。你能做到变废为宝，我要在大帅面前给你请功。”
“真的？”胡胤德转忧为喜
“那还能有假。不过，你这功劳要分我一些。”裴余庆摸出一包烟，递给胡胤德一支
胡胤德想了想，说道：“成。要是大帅真的有赏，咱们一人一半。”
裴余庆得意地笑了笑，说道：“要么我引荐，你要见大帅可难了。这样吧，这门炮性能怎么样？”
经过一番测试，这门迫击炮全重350斤，射速:6~15发/分，最大射程:5580米，最小射程:450米，高低射界:+45度~+80度，弹药基数:80发。
裴余庆摸了摸脑袋，说道：“才5580米的射程，会不会近了一些？”
胡胤德说道：“就迫击炮来说，不算近了。你要上万米的远射程大炮，那就不是几个大头兵能背得动的了。”
“那倒是。”裴余庆想了想，又说道：“这样吧，我给你配齐人手，再用厂子里的好工好料把这门炮再拾掇拾掇，整个弄好了，咱们再拿给大帅过目。”
胡胤德问道：“这样的话，那几个洋人能答应吗？”
裴余庆白了他一眼，说道：“这点事儿我还能做得了主。再说了，大帅不是一直说要培养咱们中国人自己的工程师吗？你胡胤德无师自通，大帅知道有你这么一号人，高兴还来不及。”
胡胤德乐了，喜滋滋地搓着手，说道：“那裴管事，我以后就靠你关照了。”
“包在我身上。”裴余庆拉起胡胤德，“走，我这就给你安排人手去。”
正如裴余庆预料的那样，李默涵知道这件事之后十分高兴，不光重奖了胡胤德，把他从小工升成了工程师，还提前恢复了裴余庆的职务，只不过裴余庆不再兼管机械厂，而是全身心地投入兵工厂的建设，专管枪炮设计和生产。
其实李默涵支持这个项目的原因有两个，第一个自然是因为自己的技工们已经有了自主研发的创新能力，虽然还在起步阶段，但是一样值得鼓励和欣慰。第二是因为120毫米迫击炮发射的榴弹全重159公斤，杀伤面积:56x28平方米，威力相当可观。而且在射程上5580米的最大射程和日本38式120榴弹炮的5650米相差不大，但是造价仅为日本38式120榴弹炮的五分之一。
只要想到日本造一门的钱自己却能造五门,威力和射程相差不大,就让李默涵有一种莫名的快感。