于南面，朱由检认定下一个可能是在武昌，刘宗敏很可能会对武昌下手。
但是武昌的局面非常不稳定，范景文明确告知朱由检，武昌的左良玉拥兵自重，兵力已经将近二十万。
左良玉和刘良佐不同，左良玉控制着长江要地，而且他的反心在明朝京城失陷之前就已经非常明显了。
当初李自成在荆襄做大，朝廷令左良玉从四川赶赴荆湖作战，但是左良玉没有进攻李自成，而是乘机占据了武昌这个长江中游的要害之地。
朱由检明白左良玉绝对不会像刘良佐一样负荆请罪，于是为了试探左良玉的态度，朱由检传旨左良玉来南京觐见。
结果也不出朱由检的意料，左良玉以刘宗敏大军压境为由，拒绝来南京觐见朱由检。
左良玉的态度已经非常明显了，也就是第二个刘泽清，那么朱由检在南面就必须要防备左良玉了。
最后又经过一番规划，朱由检将眼下大明朝的现在能够掌控的国土进行了一番划分。
北方分为河南省、山东省、淮安省三地，在南方分为应天府，也就是南京辖区，浙江省、江西省，湖广省、贵州省、云南省、两广省七地。
北方的河南省以汝宁府和汝宁以南的城池为辖区，设置巡抚陈潜夫，总兵高杰统御。
山东省以济南和青州两地为中心，设置巡抚吕祺卲和总兵周遇吉统御。
淮安省以徐州、凤阳、扬州三府为中心，甚至巡抚孟兆祥，总兵黄得功统御。
南方应天府，也就是南京都城，辖区以南京、安庆、镇江、杭州、苏州、绍兴、嘉定、松江等地，设置应天巡抚张秉贞。
南京是要害之地，而且朱由检将苏杭一带最富裕的地方全部涵盖进来了，于是朱由检设置了四位总兵，李守荣、刘良佐、陈子龙、黄斐四人。
李守荣担任南京总兵，统领御林军保卫都城，刘良佐镇守镇江，陈子龙驻守杭州，黄斐为南京水师总兵，统领长江水师。
浙江省以绍兴府中心，设置巡抚徐石麟，总兵陈吾统御。
江西省以南昌府为中心，由巡抚杨延麟，总兵张国维担任江西的防御。
湖广省以长沙府为中心，由湖广巡抚堵胤锡，总兵何腾蛟担任湖广省的防御。
广东和广西设置两广巡抚苏观生，总兵陈际泰，担任两广之地防御。
云南则是由黔国公沐天波镇守，沐家世代镇守云南，已经十一世，可谓忠心耿耿，而且治理云南有方，开垦屯田三十万亩之多。
贵州彝族居多，由彝族统领安坤担任总兵，统领彝族狼兵，同时安抚使左懋第。
贵州情况特殊，主要以当地彝族为主，彝族头领安坤在当地威望最高，彝族狼兵也归属安坤统领，同时明廷设置安抚使左懋第，代表朝廷安抚当地彝族，为大明效命。
经过一番划分，朱由检将眼下大明的领土都划分的差不多了，其中还有两处，一个是武昌，还有一个福建，这两地虽然是大明土地，但是左良玉和郑芝龙早就拥兵自重，已经是大明朝的敌人了。
眼下朱由检在江北需要准备豪格的南下山东之战，在江南，他需要准备防御左良玉，此时左良玉佣兵二十万，战船五百多艘，势力庞大，随时可以成为当年的陈友谅，顺江南下攻打南京。
李守荣担任南京总兵，同时朱由检令他负责安庆防御，安庆是武昌南下的要地，如果安庆守不住，那么南京就危险了。
朱由检眼下最重要的事情就是招募新兵，各省兵马自行招募训练，基本保持在三万到五万之间，其中精兵保持在一万人以上，剩下的则以民兵守备军为主。
这也是当下的实际情况，各省的兵源多数都是农民，战事作战，闲时生产。
至于南京城，朱由检的计划组建精兵五万，民兵十五万，保持兵力的优势，准备迎战左良玉和刘宗敏。
兵部尚书张缙彦到了南京之后，整日带着兵部的官员下去招募新兵，这次张缙彦可是有了底气。
当初在京城招募新兵，张缙彦手中无钱无粮，但是现在好了，朱由检一出手就是五十万两，新兵入伍安家费一人五两，每个月军饷一两，进入精锐部队，饷银还会更高，战时会提升军饷。
这样的条件立刻让江南青年踊跃参军，只要是有些力气的，都争相来到招兵处报名。
计划招募的二十万新兵很快就完成了，这些新兵都是符合体检要求的，他们会在新兵训练场进行三个月的集训，然后挑选出五万人作为精锐使用，剩下的十五万人则会安置到南京辖区的州府守备。
朱由检来到南京之后，以雷厉风行的手段，在短短的一个月内，就完成了新朝廷和各地战区的划分。
但是也引起了很多人的不满，其中就有在江南势力庞大的东林党集团。