，而是呈现渐次增多的态势，直到弘治年间，才基本确定了其主要的职责范畴。
京师治理体系庞大而复杂，宫城、皇城、京城各自设有相应的治理机构。在京师五城，除五城兵马司之外，涉及到的主要治理机构还有巡城御史、厂卫、六部、顺天府，宛、大二县及巡捕营。
上面的这些衙门又都与兵马司存在职权的交叉；因而，就需要在处理具体事务的时候，诸衙门之间相互配合、协调。
可是，朱重八草莽出身，是最懂得人心的，所以设置这些衙门的理念，就是互不统属、分权制衡，由此也带来了权责不明，造成了权力的滥用与侵夺，因责权的重叠，就妨碍了京师治理的高效化。
所以九门下钥的命令下达，却依旧让红氏等人，混杂在伏阙上书的人们当中溜出了京畿。五城兵马司又因是武职，被顺天府、大理寺等衙门所无视；因其位小职卑，所属权力往往受到高层权力体的侵蚀，从而被派加其职责范畴之外的役使，其中尤以厂卫及巡城御史为甚。
最应该对京师负责的五城兵马司，却常常被巡城御史和厂卫呼来唤去，成为了其门下的使奴唤婢。到崇祯当朝，由于京师居民不愿坐铺、京师实际治理的任务量增加，以及五城兵马司自身渎职枉法等原因，其治理功效颇受削弱。
这一次更是成为了巡城御史、厂卫、六部、顺天府，宛、大二县及巡捕营的替罪羊。本来辑匪捕盗是五城兵马司的天职，可是责罚的板子落在了五城兵马司的身上，而捉拿匪人的重任，却落在了皇帝最为亲信的御马监太监手上。
大明朝的一十六位皇帝，各个奇葩。明朝，宦官共置二十四个衙门，分别有十二监、四局、八司，其实不是所有宦官都被称为太监，反而是作为各衙门的最高统领宦官，才有资格被称作太监。
在这二十四个衙门中，最受皇帝重视的，就是司礼监和御马监。御马监本来作为给皇帝牵马坠蹬的所在，反而成为了不是专业养马的地方；崇祯朝的御马监，更是与兵部及督抚共执兵柄，实为内廷之枢府。
另外，御马监还要管理草场和皇庄；经营皇店同户部一起分理崇祯朝的财政，所以权柄极重，真称得上是有枪、有粮还有饷。此外，明朝两度设置的西厂，也是由御马监太监担任提督的，他们与司礼监太监担任提督的东厂分庭抗礼相互制衡。所以，明朝阉党能够权倾一时多拜亲昵他们的皇帝所赐。
明朝的开国皇帝，明太祖朱元璋，出身并不是门阀士族，所以开国后官职虽说是效仿元制，但是他改良了一下，废除了权倾朝野的丞相，集天下大权于己身；可是，一个放牛娃小出身的小和尚，虽然天赋异禀，但是天下繁文缛节的奏折，也让他一个人看了头疼。