在之前，曾经几度提醒过启皇帝及内阁，可是大家都不听他的，现在孙承宗一发话，熊廷弼果然下狱了，方震孺也被罢官。
当时朝堂中同情熊廷弼的朝臣不少，甚至还有人提出应该重新启用熊廷弼，孙承宗刚刚上任，正是“踌躇满志”的时侯，面临着这些质疑的声间，孙承宗需要拿出政绩来证明自己不光是个教书学生，自己也是懂军事的行家；来也巧，王在晋这个时侯提出来修八里铺长城，孙承宗本来就看王在晋这个新任辽东经略不太顺眼，于是孙承宗主动提出来要去山海关来个实地考察。
启皇帝听到这个消息大喜，给自己的这位“大胡子老师”加太子太保，赐蟒玉、银币。孙承宗这次来到山海关，王在晋主动地向他谈起自己的八里铺筑城计划，两个人之间发生了一场很有意思的对话。
孙承宗后来专门跟启皇帝上的奏折里谈到了这次对象：“臣时执偏见，谓经臣（王在晋）议诚然，独是八里为两城，而旧城之坑、壕、空营当在三里之外，而新城之守卒法当四万则四万之退步跟将及之，而一不戒，将城下之备尽为我设，北山南水既无旁出，而贼方拥此四万于旧城之下，开关延之不可，闭关谢之不可将城上之备，又为我设，而城中惊溃无问也。
经臣曰：于山建山寨三，以为退守计，而三道关俱可入孙子兵法云：’置之死地而生‘经臣言边兵善走也，即杀不能止，况大势散，谁复为杀者故为两城以固其心，而实置之死以励其必死之气，臣遂无以应“
孙承宗一向是个在京城的清贵翰林官，而王在晋则从地方上一层层升起来，两人对于实务的熟悉程度自然不可能一样，所以孙承宗在这封奏折里坦承自己在与王在晋的交谈中处于下锋--臣时执偏见；同时他也坦承自己对辽东军的了解，根本没有王在晋那么深刻，辽兵在阵前善于逃走、即使执法官在阵前杀戮也来不及阻止这些情况，孙承宗都是没有想到的，所以孙承宗坦陈自己臣遂无以应。
孙承宗虽然在跟王在晋的交锋中先折了一阵，然而，孙承宗毕竟是简在帝心的帝师、内阁成员，的挫折让孙承宗越挫越勇，很快他就想到了怎样扳回劣势；王在晋在孙承宗没来之前，安置难民、清点兵员、盔甲、器械，忙得团团转；现在孙承宗来了，王在晋也乐得轻松，可是没过几，他的下属来找他反映，孙承宗每关在自己的府衙里，不知道忙什么。
王在晋一听就明白，原来之前他曾经跟孙承宗在兵部短暂供过事，后来自己也道：“孙公一日入阁，一日于兵部大房决事，左右侍郎力趣之，终日不出堂。凡发一疏更削数次写本，人役甚苦之，部务如丛，日至壅积；予初总理三部及署部，晨入暮归无晷刻之暇，今得越旦进部，旷日悠闲，心热于边声之至急矣。”