2100的第二次世界冲击，官方明面上的解释是陨石落在南极，造成了地球经纬度偏转，各地气候都有了不同的变化。
例如日本，全年皆夏。
而现在，世界各地的气象站全部发布一个预示，全球气候将全部变冷，这预示着，冬天，要来了。
第三东京，那座曾经的要塞都市，现在只剩下了废墟，葛城美里她们联系到原本和nerv有合作关系的军方，准备成立新的部门来预防seele的计划。
原本的nerv只是seele执行人类补完计划的一颗棋子，同时也是碇源堂成神计划的棋子，然而在葛城美里了解到部分真相之后，决定阻止人类补完计划的执行。
“这种将自己的意志强加于所有人身上，算什么为他人考虑，不过是一群自私主义者罢了。”
葛城美里从心底不认同人类补完计划这种东西的，人与人之间心的融合，是必须通过自身的语言和意识的交流来沟通，强行解开心之壁，不能算得上人类真正的心的交流，只不过是把两滩lcl溶液混合在了一起。
“所以，你要做什么？”
葛城美里将身上的外套丢在了地上。
“从今天开始，我们的名字叫wille，我们的目标是阻止人类补完计划。”
“哪怕是会和那个孩子作对？”
赤木律子在最后的时候还对碇源堂抱有一丝希望，可现在她知道了，一切都是不可能的，碇源堂甚至离去的时候，都只带走了绫波丽的复制品，而不是自己。
她连一个复制品都比不过。
“哪怕是会和真嗣战斗，我也做好了杀死他的准备。”
赤木律子还是觉得和有胆量发动世界冲击的真嗣战斗是一件不怎么理智的事情，nerv，不，wille有什么？
真嗣有已经是觉醒状态的初号机，seele有九台无尽能源的量产机，碇源堂，他到底还有没有底牌，赤木律子不知道。
只有wille，这个新成立的组织，什么都没有。
情报，资金，eva，盟友，驾驶员，都没有。
“我们拿什么和他们斗？”
seele的目的是人类补完计划，碇源堂一定还会再想办法引发一次世界冲击，真嗣的目的同样是如此，wille用什么来阻止他们？
葛城美里也想叹气。
“总会有办法的。”
一阵冷风吹过，葛城美里打了个寒颤，又把地上的外套捡了起来穿上。
“过会儿再丢吧。”
两人正在谈话之际，一个陌生的女性声音在不远处响起。
“这一切都是小狗君做的？”
在欧洲那边处理好后事以后的真希波，突然收到信息，第三东京市引发了一次世界冲击，真希波的脑海里面顿时就浮现出了真嗣的脸庞，连忙马不停蹄的赶了过来。
葛城美里觉得这人好像有些熟悉，上前询问。
“你是？”
“我是欧洲分部那边的适格者，八号机驾驶员，真希波。”
葛城美里眼睛一亮。
转头对赤木律子说道：“现在我们有eva和驾驶员了。”
和真希波交流了一下之后。
接着，葛城美里电话响起。
“我们在城市东郊发现了初号机，插入栓不在，没有搜寻到驾驶员碇真嗣。”
挂断电话之后，葛城美里的脸上多出了一丝笑意。
“现在我们又有了初号机。”
胜算增加了，世界接下来不知道会发生什么样子的变动，多上一台拥有无限能源的初号机，便足以构建出一座城市。
话还没有说完，葛城美里的对讲机里面响起了日向诚的声音。
“明日香醒了！”
现在，二号机驾驶员也已经就位，wille，完全有一战之力了！
……
“我死了？”
恢复意识的时候，明日香睁眼，周围就是一片黑暗，她差点就以为自己已经死了。
身体的虚弱感和精神上的异样，让她有种一种活着的时候的感觉，如果死了的话，不会这么累的。
双手在废墟中摸索着前进，周围满是尖锐是石块和水泥之中暴露出来的钢筋，幸运的是，随便碰到明日香都能杀死她的这些东西，刚好完美的避开了当时在病床上昏迷的她。
nerv地下基地虽然坍塌，不过好在还有一部分通道可以使用，明日香也是靠着那些通道，找到了电话，联系上了nerv的人。
从地下出来的时候，明日香的眼睛都差点受不了。
“这到底是怎么回事啊！”
明日香小声的嘟囔了一句。
整个第三东京市被抹除干净了，eva的力量有这么强大吗？
“笨蛋真嗣，你在哪里？本小姐出来了，还不过来给我捏脚。”
第三东京市没了确实是一件大事，但更重要的是真嗣现在在哪里，这里变成这样，明日香总觉得和他脱不了干系。
两个人才刚确定关系不久，对明日香来说，正处于热恋期，怎么能不关心真嗣。
众人全部沉默。
“伊吹，你来给她说明一下情况。”